21-羟化酶缺乏症为最常见的一种先天性肾上腺皮质增生症(CAH)占90-95%，是一种常见的家族性常染色体隐性遗传病，由于皮质激素合成过程中所需酶的先天性缺陷所致。该病在新生儿的发病率为1/5000-1/15000，人群的携带率为1/20-1/25。

该病由编码21-羟化酶的 CYP21A2 基因变异导致，常见基因变异包括缺失/重复和点变异，引起21-羟化酶缺乏或不足，不同变异影响酶活性的不同程度与临床表型严重程度密切相关。

CYP21A2 基因定位于染色体6p21.3的人类白细胞抗原（HLA）III类基因区，同时与补体C4A、C4B编码基因串联重叠排列。



CYP21A2 基因（真基因）与假基因 CYP21A1P 高度同源，二者核苷酸序列一致性高达98%以上。真假基因间可出现各种复杂的重组情况。重组可导致 CYP21A2 基因缺失或点变异。常见的捕获测序无法区分真假基因；一代测序（Sanger测序）或qPCR因为真假基因的同源序列而很难在每个外显子上设计合适引物，这些局限性导致常规方法无法准确检测 CYP21A2 基因各种类型的变异。