骨骼相关遗传病概述
个别遗传性骨骼疾病是很罕见的,但不同类型的疾病组成较大的患病人群,并呈现显著的发病率和死亡率。在活产婴儿中,大约1/5000具有因骨头、软骨和关节发育絮乱造成的骨骼发育不良,是新生儿出生缺陷的常见原因之一[ PMID:20556869 ]。遗传性骨骼疾病可以作为独立的疾病出现,也可是其他疾病或综合征的伴随表型。值得注意的是,相同的骨骼发育不良基因可导致基本不同的临床表型,或者可以由不同基因的变异引起特异的骨骼表型。因此,了解基因型-表型相关性和功能多样性仍然是遗传性骨骼疾病的主要挑战之一:几乎所有遗传性模式都可出现在遗传性骨骼疾病中,患病个体以单个核苷酸的变异(SNV)为多,达72%[ PMID:27580923 ],但也可见拷贝数变异(CNV)[ PMID:24343915 ]。
常见骨骼发育不良
|成骨不全(Osteogenesis imperfeca)
成骨不全以骨骼的脆性增加进而易引发骨折为特征,其临床表现严重程度可从严重的围产期致死至具有正常寿命的无症状轻度骨折[ PMID:25046257]。其他常见的特征包括牙本质发育不全、蓝巩膜、成年后身材矮小和听力损失等。II型成骨不全最为致命,其特点是具有严重的短肢畸形、长骨弯曲多发性骨折和狭小的胸廓等。所有类型的成骨不全累积发病率为1/30000~1/15000,其中约90%病例是由COL1A1 或COL1A2 的致病性变异引起[ PMID:18635629 ]。
|软骨发育不全(Achondrogenesis)
软骨发育不全是一种严重的骨骼发育异常疾病,分为三种类型:IA型、IB型和II型,临床特点为细短肢畸形、筒形短躯干和短肋等[ PMID:24868173 ]。II型软骨发育不全最为常见,约占80%,常因软骨发育不全COL2A1 基因的新发显性致病变异所致 [ PMID:18990981 ]。IA型是由于SLC26A2 基因的致病变异引起,而IB型发病于TRIP11 基因的致病变异[ PMID:24868173 ]。这三种类型通常在围产期都是致命的。
嘉检骨骼相关遗传病检测基因包
嘉检骨骼系统优选基因包针对成骨不全、骨代谢性疾病、遗传性佝偻病、身材矮小等疾病进行检测,可同时分析SNV和indel(包括已知致病内含子变异)、拷贝数变异(CNV)、AOH,尤其是新型变异、罕见变异及嵌合变异等。
注:基因包内的所有基因均可以单独检测,并根据患者的临床表型进行调整,且随着医学的发展而有所变化,详情可咨询400-179-2998。
精典病例 - 成骨不全
检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括2,186个相关基因,30,962个编码区总共含5,152,686个碱基。
平均覆盖深度287+/-145X,大于10X覆盖区间占99.9%,大于20X覆盖区间占99.7%。
基因名称 | OMIM编号 | 遗传方式 | HG19位置 | 转录本 | 基因区 | 核苷酸与氨基酸改变 | 合子状态 | 人群频率 | ACMG变异 分类 | 相关疾病/文献 | 来源 |
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COL1A1 | 120150 | AD | chr17:4826xxxx | NM_000088 | - | c.3xxx_3xxxdel29(p.P1xxxAfs*18) | 杂合 | - | 2类-可能致病 | 成骨不全1型 | 母亲(杂合) |
① 极小创伤或无外伤引起的骨折、不同程度的牙本质发育不全和蓝巩膜。
精典病例 - 特发性家族性身材矮小等
检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括2,186个相关基因,30,962个编码区总共含5,152,686个碱基。
平均覆盖深度267+/-126X,大于10X覆盖区间占99.9%,大于20X覆盖区间占99.8%。
基因名称 | OMIM编号 | 遗传方式 | HG19位置 | 转录本 | 基因区 | 核苷酸与氨基酸改变 | 合子状态 | 人群频率 | ACMG变异 分类 | 相关疾病/文献 | 来源 |
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SHOX | 312865 | XL-PD/PR | chrX:60xxxx | NM_000451 | - | c.6xxC>T(p.A2xxV) | 杂合 | 0.003东亚 | 3类-意义未明 | Langer肢中骨发育不良/Leri Weill软骨发育不良/特发性家族性身材矮小 | - |
SHOX | 312865 | XL-PD/PR | chrX:59xxxx | NM_000451 | - | c.2xxA?(1号外显子断点) | 杂合 | - | 2类-可能致病 | Langer肢中骨发育不良/Leri Weill软骨发育不良/特发性家族性身材矮小 | - |
① 身材矮小、肢中段短小和马德隆畸形。