遗传代谢病
遗传代谢病(Inherited Metabolic Disease,IMD或Inborn Errors of Metabolism,IEM),是指由遗传因素即相关基因变异引起的酶、受体、载体等蛋白功能缺陷,导致体内生化物质在合成、代谢、转运和储存等方面出现异常,产生一系列临床症状的一大类疾病。常见IEM约有500多种,多为单基因病。虽然单一病种的发病率在几万分之一到几千万分之一之间,但IEM总体发病率较高。
IEM的遗传模式绝大多数为常染色体隐性遗传,少数为X-连锁遗传和线粒体遗传。临床表现多样,全身各器官均可受累,神经系统和消化系统的表现较突出。急性症状包括急性代谢性脑病、代谢性酸中毒、高氨血症等。
IEM的分类
|按影响细胞器分类: ◎ 溶酶体病 ◎ 线粒体病 ◎ 过氧化物酶体病
|按异常小分子代谢物分类:
临床提示可能相关的IEM的常见表型
嘉检遗传代谢病检测基因包
嘉检遗传代谢病优选基因包涵盖临床常见的氨基酸代谢性遗传病、有机酸代谢性遗传病、脂肪酸代谢性遗传病、高氨血症、先天性低血糖、甲基丙二酸血症等。可同时分析SNV和indel(包括已知致病内含子变异)、拷贝数变异(CNV)、AOH,尤其是新型变异、罕见变异及嵌合变异等。
注:基因包内的所有基因均可以单独检测,并根据患者的临床表型进行调整,且随着医学的发展而有所变化,详情可咨询400-179-2998。
精典病例 - 新生儿瓜氨酸血症
检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括817个相关基因,10,502个编码区总共含1,609,788个碱基。
平均覆盖深度286+/-156X,大于10X覆盖区间占99.9%,大于20X覆盖区间占99.7%。
基因名称 | OMIM编号 | 遗传方式 | HG19位置 | 转录本 | 基因区 | 核苷酸与氨基酸改变 | 合子状态 | 人群频率 | ACMG变异 分类 | 相关疾病/文献 | 来源 |
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SLC25A13 | 603859 | AR | chr7:9581xxxx | NM_014251 | - | c.xxx_xxxdelTATG(p.MxxxPfs*2) | 杂合 | 0.005东亚 | 1类-致病变异 | 新生儿瓜氨酸血症II型 | 母亲(杂合) |
SLC25A13 | 603859 | AR | chr7:9575xxxx-9575xxxx | NM_014251 | - | c.xxxx_xxxxins3kb | 杂合 | - | 1类-致病变异 | 新生儿瓜氨酸血症II型 | 父亲(杂合) |
① 肝内胆汁淤积,胆红素升高,肝功能异常,黄疸和胆汁酸水平较高等。
精典病例 - 原发性肉碱缺乏症
检测结果质控统计:这个综合征基因包检测区间包括817个相关基因,10,502个编码区总共含1,609,788个碱基。
平均覆盖深度290+/-161X,大于10X覆盖区间占99.9%,大于20X覆盖区间占99.8%。
基因名称 | OMIM编号 | 遗传方式 | HG19位置 | 转录本 | 基因区 | 核苷酸与氨基酸改变 | 合子状态 | 人群频率 | ACMG变异 分类 | 相关疾病/文献 | 来源 |
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SLC22A5 | 603377 | AR | chr5:13172xxxx | NM_003060 | - | c.7xxC>T(p.Rxx4*) | 杂合 | 0.0013东亚 | 1类-致病变异 | 原发性肉碱缺乏症 | 母亲(杂合) |
SLC22A5 | 603377 | AR | chr5:13172xxxx | NM_003060 | - | c.8xxC>T(p.Rxx9*) | 杂合 | <0.001 | 1类-致病变异 | 原发性肉碱缺乏症 | 父亲(杂合) |
① 代谢代偿失调,低血糖,嗜睡,肝肿大,肝转氨酶升高等。